Коэволюция человека и бактерий

Откуда возникли патогены, которые нас заражают сегодня? В чем особенность бактерий, вызывающих туберкулез, проказу и язву желудка? Связаны ли между собой карта мирового генетического разнообразия возбудителей болезней с генетическим разнообразием людей? Об этом рассказывает микробиолог Константин Северинов.

Откуда возникли патогены, которые нас заражают? Может быть две гипотезы: первая — что человечество в ходе своего распространения по планете сталкивалось с патогенами, которые, например, заражали животных, бывших характерными для той или иной зоны; потом эти зоонозы, то есть болезни, свойственные животным, каким-то образом передавались людям. Вторая — что некоторые возбудители бактериальных болезней просто присущи нам как виду, и, может быть, ситуация как раз обратна: какие-то из домашних животных или те животные, которые с нами общаются наиболее плотно, от нас и приобрели заболевания.

Точно так же, как можно смотреть на полиморфизм, или изменения, характерные для каких-то групп людей, можно смотреть на изменения в бактериях, которые находятся в этих людях. Здесь мы можем ожидать разные сценарии. У нас есть возможность определить геномные последовательности разных изолятов бактерий, собранных у разных групп людей, а потом построить или попытаться построить некую карту, или филогению того, как именно возникло существующее разнообразие этих бактерий.

Возникает новое направление — почти антропологическая микробиология. Те микробы, которые в нас живут, называются микробиомы — это огромное количество самых разнообразных живых существ. Они действительно живые, ничем не хуже нас — они просто живут на нас. Новые методы позволяют изучать эти микробиомы, определять последовательности всех бактерий, которые специфичны для того или другого места обитания человека: слизистые, кожа, кишечник и так далее. В ближайшее время будет появляться все больше и больше работ, в которых будет исследоваться изменчивость этого микробиома в связи с разнообразием людей и попытками каким-то образом коррелировать разнообразие людей, их историю, с теми микробами, которые на них живут.