Популяционная геномика суперизменчивых организмов

Что понимается под генетической изменчивостью? Каков уровень генетической изменчивости человека? И как действует положительный отбор? Об этом рассказывает кандидат биологических наук Алексей Кондрашов.

Существует понятие генетической изменчивости (у разных организмов разные генотипы). В данном случае возникает терминологическая неряшливость, потому что слова «генотип» и «геном» используют как синонимы. Это не совсем синонимы. У человека (индивида) не геном, а генотип. Даже на самом деле два генотипа — от мамы и от папы. Когда говорят о геноме, имеют в виду общий знаменатель, некий консенсус большого количества генотипов. То есть вид homo sapiens имеет геном, а каждый отдельный организм имеет свой собственный генотип. У разных организмов генотипы разные. И это называется генетической изменчивостью.

Степень генетической гетерогенности шизофилума позволяет ставить совершенно новые вопросы. Прежде всего, как действует отбор? Потому что естественный отбор оставляет некие отпечатки (как говорят, подписи) в структуре генетической изменчивости. Если в каком-то месте отбор отрицательный (то есть он изменчивость отсекает), соответственно, в этом месте изменчивость будет понижена. В зонах, где нуклеотидная замена вызовет замену аминокислоты, мы видим снижение генетической изменчивости. Но если у вас различие всего в одну букву на тысячу, то заметить это трудно. Если различие в одну букву на семь, то, просто сравнив несколько десятков генотипов из одной популяции, мы можем идентифицировать отдельные буквы, находящиеся под действием естественного отбора.

Можно изучать действие отрицательного отбора совершенно беспрецедентным разрешением. А еще интереснее, что можно изучать действие положительного отбора. Отрицательный отбор — это отбор, который благоприятствует тому, что популяция и так частая. А положительный отбор благоприятствует тому, что популяция в данный момент редкая; вызывает изменения.